Linhas de pesquisa:
  - Oceanografia Química em Águas Costeiras, Oceânicas e Estuarinas.
  
 Área de concentração: Oceanografia Abiótica
 Descrição: Esta linha se dedica ao estudo das variáveis químicas dos ecossistemas marinhos e costeiros e suas interações com processos físicos e biológicos.
  - Oceanografia Física em Águas Costeiras, Oceânicas e Estuarinas.
  
 Área de concentração: Oceanografia Abiótica
 Descrição: Caracterização e distribuição de propriedades físicas e processos físico-oceanográficos em áreas estuarinas, costeiras e oceânicas. Modelagem numérica de processos físicos-oceanográficos.
  - Oceanografia geológica em Áreas Estuarinas, Costeiras e Oceânicas
  
 Área de concentração: Oceanografia Abiótica
 Descrição: Esta linha se dedica ao estudo geológico, geomorfológico e geofísico de ambientes marinhos e costeiros.
  Área de concentração: Oceanografia Abiótica
 Descrição: Estudos dos poluentes tais como: metais pesados, dispersão de poluentes, poluentes orgânicos, etc. em áreas costeiras. Estudos de toxicidade ou efeitos destes poluentes sobre a biota.
  - Fitoplâncton em Águas Estuarinas, Costeiras e Oceânicas
  
 Área de concentração: Oceanografia Biológica
 Descrição: Ecologia e sistemática dos organismos fitoplanctônicos; organismos bioindicadores; produção fitoplanctônica nos ambientes costeiros e oceânicos.
  - Zooplâncton em Águas Estuarinas, Costeiras e Oceânicas
  
 Área de concentração: Oceanografia Biológica
 Descrição: Ecologia e sistemática dos organismos zooplanctônicos, seus padrões de dispersão e suas interações com outros elos da teia alimentar marinha.
  - Nécton em Águas Estuarinas, Costeiras e Oceânicas
  
 Área de concentração: Oceanografia Biológica
 Descrição: Esta linha se dedica ao estudo da sistemática, ecologia e dinâmica populacional de peixes estuarinos, recifais e oceânicos. São ainda realizados estudos com mamíferos marinhos, mais especialmente o Peixe-boi Marinho.
  - Bentos em Águas Estuarinas, Costeiras e Oceânicas.
  
 Área de concentração: Oceanografia Biológica
 Descrição: Sistemática e ecologia dos diversos grupos de organismos bentônicos, estudos de dinâmica populacional destes organismos. São realizados estudos com crustáceos, poríferos, moluscos da macrofauna e copépodos e nematódeos da meiofauna.
  Área de concentração: Oceanografia Biológica
 Descrição: Cultivo de peixes, moluscos, crustáceos, organismos zooplanctônicos e microalgas marinhas e estuarinas.
  Área de concentração: Oceanografia Biológica
 Descrição: Nesta linha de pesquisa são desenvolvidos projetos integrados que estudam de forma interdisciplinar os ambientes costeiros e oceânicos, levando em conta os aspectos sociais, econômicos além dos ambientais.
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